Comment sélectionner les atomes dans le pymol ?

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Comment sélectionner les atomes dans le pymol ?
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Vidéo: Comment sélectionner les atomes dans le pymol ?

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Anonim

Lorsque vous cliquez-gauche-et-relâchez sur un atome à l'aide du bouton gauche, PyMOL devrait, par défaut, sélectionner le résidu entier: cela créera une entrée "(sele)" dans le panneau de contrôle sur lequel il est possible d'agir à l'aide des menus contextuels.

Comment sélectionnez-vous les choses dans PyMOL ?

select

  1. Utilisation. select name, selection [, enable [, quiet [, merge [, state [, domain]
  2. Arguments. name=un nom unique pour la sélection. …
  3. Exemples. select chA, chain A select (resn his) select near142, resi 142 around 5.
  4. Remarques. …
  5. Voir aussi. …
  6. Plus.

Comment sélectionnez-vous les obligations dans PyMOL ?

Vous pouvez facilement créer une nouvelle liaison en sélectionnant deux atomes, chacun avec le CTRL-MIDDLE-MOUSE-BUTTON et en tapant "bond" sur la ligne de commande.

Comment sélectionner un acide aminé spécifique dans PyMOL ?

– sous le menu "affichage" sélectionnez "séquence activée". Une barre apparaîtra au-dessus de la structure montrant la séquence d'acides aminés de toutes les chaînes protéiques dans la fenêtre. Utilisez option-shift pour sélectionner tous les aa pour une chaîne.

Comment sélectionner une séquence dans PyMOL ?

Réponse la plus récente

  1. Chargez votre structure protéique en pymol.
  2. Cliquez sur le bouton 'S' pour charger la séquence d'acides aminés.
  3. Trouvez la séquence d'acides aminés que vous souhaitez afficher et sélectionnez-la.
  4. vous pouvez changer leur couleur ou leur mode d'apparence (tel que dessin animé, sphères, rubans, bâtons, surface, etc.)

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