Table des matières:
- Qu'est-ce que le format bigWig ?
- Comment utiliser le fichier bigWig ?
- Qu'est-ce qu'une piste bigWig ?
- Comment créer un fichier bigWig ?
Vidéo: Qu'est-ce qu'un fichier Bigwig ?
2024 Auteur: Fiona Howard | [email protected]. Dernière modifié: 2024-01-10 06:37
BigWig est un format de fichier pour l'affichage de données denses et continues dans une piste de navigateur de génome, créé par conversion à partir du format Wiggle (WIG). Le format BigWig est décrit sur le site Web de l'UCSC Genome Bioinformatics et le guide de format de fichier du Broad Institute fournit des informations supplémentaires.
Qu'est-ce que le format bigWig ?
Le format bigWig est pour l'affichage de données denses et continues qui seront affichées sous forme de graphique Les fichiers BigWig sont initialement créés à partir de fichiers de type WIG, à l'aide du programme UCSC wigToBigWig. Alternativement, les fichiers bigWig peuvent être créés à partir de fichiers bedGraph, en utilisant le programme UCSC bedGraphToBigWig.
Comment utiliser le fichier bigWig ?
Déplacez le fichier bigWig nouvellement créé (myBigWig.bw) vers un emplacement http, https ou ftp accessible sur le Web. Collez l'URL dans le formulaire d'entrée de piste personnalisée ou créez une piste personnalisée à l'aide d'une seule ligne de piste. Collez la ligne de piste personnalisée dans la zone de texte de la page de gestion des pistes personnalisées.
Qu'est-ce qu'une piste bigWig ?
bigWig Tracks sont tracks pour les signaux continus sur l'ensemble du génome. Ils conviennent à l'affichage de divers résultats d'expériences "bruts" tels que les signaux ChIP-Seq, les signaux RNA-Seq, etc.
Comment créer un fichier bigWig ?
Il existe plusieurs façons de générer des fichiers Bigwig. Cela implique généralement la conversion d'un fichier. bam en une piste wiggle (. wig), puis en convertissant la piste wiggle en un bigwig binaire (.
Conseillé:
Qu'est-ce qu'un fichier ctg ?
CTG est un fichier d'index de catalogue créé sur les appareils photo numériques Canon, stocké dans le dossier CANONMSC qui correspond aux autres dossiers enregistrés sur la carte mémoire. Les fichiers CTG contiennent des informations sur le nombre d'images stockées dans chaque dossier de la carte mémoire.
Qu'est-ce qu'un fichier exécutable ?
En informatique, un code exécutable, un fichier exécutable ou un programme exécutable, parfois simplement appelé exécutable ou binaire, amène un ordinateur "à effectuer des tâches indiquées selon des instructions codées", par opposition à un fichier de données qui doit être interprété par un programme pour être significatif.
Où est créé le fichier de vidage de tas ?
Par défaut, le vidage du tas est créé dans un fichier nommé java_pidpid. hprof dans le répertoire de travail de la VM, comme dans l'exemple ci-dessus. Vous pouvez spécifier un nom de fichier ou un répertoire alternatif avec l'option -XX:HeapDumpPath= .
Qu'est-ce qu'un fichier fdx ?
Un fichier avec l'extension de fichier FDX ou FDR est un fichier Final Draft Document. Ces types de fichiers sont utilisés par le logiciel de scénarisation Final Draft pour stocker des scripts pour des épisodes télévisés, des films et des pièces de théâtre .
Lequel des éléments suivants est utilisé pour vérifier qu'un fichier est classé par ordre alphabétique ?
Lequel des éléments suivants est utilisé pour vérifier qu'un fichier est classé par ordre alphabétique ? Description – Utilisez l'option - c avec l'utilitaire de tri pour vérifier qu'un fichier a été trié . Lequel des éléments suivants est utilisé pour décompresser les fichiers ?
