Operational taxonomic unit ou OTU est considérée comme l'unité de base utilisée en taxonomie numérique. Ces unités peuvent faire référence à un individu, une espèce, un genre ou une classe. Dans les méthodes numériques, les unités taxonomiques utilisées ne sont constamment pas comparables aux unités taxonomiques formelles.
Comment se fait la classification par taxonomie numérique ?
La taxonomie numérique est un système de classification en systématique biologique qui traite du regroupement par des méthodes numériques d'unités taxonomiques en fonction de leurs états de caractère Il vise à créer une taxonomie à l'aide d'algorithmes numériques comme l'analyse par grappes plutôt que d'utiliser une évaluation subjective de leurs propriétés.
Que sont les OTU en botanique ?
Operational Taxonomic Unit (OTU) Au sein d'une même espèce, il existe une diversité génétique (selon les séquences de nucléotides). Une OTU est un regroupement d'individus d'une même espèce dont les séquences d'ARNr 16S présentent une similarité de 97,5 %.
Quelle est l'unité de base de la taxonomie numérique ?
Unité taxonomique opérationnelle est l'unité de base de la taxonomie numérique. Il peut s'agir d'un individu, d'une espèce, d'un genre, d'une famille, d'un ordre ou d'une classe.
Quel gène est généralement utilisé pour définir les UTO bactériennes ?
Le concept d'unités taxonomiques opérationnelles (OTU), qui construit des taxons définis "mathématiquement", est largement accepté et appliqué pour décrire les communautés bactériennes à l'aide du séquençage d'amplicon du gène de l'ARNr 16S.
