BLAST est un algorithme informatique qui peut être utilisé en ligne sur le site Web du National Center for Biotechnology Information (NCBI), ainsi que sur de nombreux autres sites. BLAST peut rapidement aligner et comparer une séquence d'ADN de requête avec une base de données de séquences, ce qui en fait un outil essentiel dans la recherche génomique en cours.
BLAST est-il une base de données primaire ?
BLAST est le logiciel le plus largement utilisé dans la recherche en bioinformatique. Sa fonction principale est de comparer une séquence d'intérêt, la séquence de requête, aux séquences d'une large base de données BLAST rapporte ensuite les meilleures correspondances, ou "hits", trouvées dans la base de données. Ce programme simple a deux applications principales.
Le NCBI est-il une base de données ?
Le NCBI abrite une série de bases de données pertinentes pour la biotechnologie et la biomédecine et constitue une ressource importante pour les outils et services bioinformatiques. Les principales bases de données comprennent GenBank pour les séquences d'ADN et PubMed, une base de données bibliographique pour la littérature biomédicale. D'autres bases de données incluent la base de données NCBI Epigenomics.
BLAST n'est-il utilisé que dans les bases de données NCBI ?
BLAST est disponible sur le site Web du NCBI. Différents types de BLAST sont disponibles selon les séquences de requêtes et les bases de données cibles.
Comment fonctionne la base de données BLAST ?
Comment fonctionne BLAST ? BLAST identifie les séquences homologues à l'aide d'une méthode heuristique qui trouve initialement des correspondances courtes entre deux séquences; ainsi, la méthode ne prend pas en compte tout l'espace de séquence. Après la correspondance initiale, BLAST tente de démarrer des alignements locaux à partir de ces correspondances initiales.
