En biologie moléculaire et en bioinformatique, la séquence consensus est l'ordre calculé des résidus les plus fréquents, qu'il s'agisse de nucléotides ou d'acides aminés, trouvés à chaque position dans un alignement de séquences.
Qu'entend-on par séquence consensus ?
Une séquence consensus est une séquence d'ADN, d'ARN ou de protéine qui représente des séquences apparentées alignées … Dans les protéines, les séquences consensus peuvent représenter des molécules protéiques entières ou de courts fragments de celles-ci qui correspondent à des régions conservées importantes pour la structure et la fonction.
Qu'est-ce qu'une séquence consensus dans l'ADN ?
Une séquence théorique représentative de nucléotides ou d'acides aminés dans laquelle chaque nucléotide ou acide aminé est celui qui apparaît le plus fréquemment à ce site dans les différentes séquences présentes dans la nature. La phrase fait également référence à une séquence réelle qui se rapproche du consensus théorique.
Qu'est-ce qu'un exemple de séquence consensus ?
Une séquence consensus est une séquence promotrice idéale dans l'ADN - dans E. coli, par exemple, on en trouve deux, une séquence -35 et une séquence -10. La séquence consensus -35 est TTGACA et la séquence consensus -10 est TATAAT. …
Pourquoi sont-elles appelées séquences consensus ?
Notation. Les motifs de séquence conservés sont appelés séquences consensus et ils montrent quels résidus sont conservés et quels résidus sont variables.
