La métagénomique est définie comme l'analyse génétique directe des génomes contenus avec un échantillon environnemental Le domaine a d'abord commencé par le clonage de l'ADN environnemental, suivi d'un criblage d'expression fonctionnelle [1], et a ensuite été rapidement complété par un séquençage aléatoire direct de l'ADN environnemental [2, 3].
Quel est le processus de la métagénomique ?
Métagénomique implique l'obtention de l'ADN de tous les micro-organismes d'une communauté, sans nécessairement identifier toutes les espèces impliquées. Une fois les gènes séquencés et comparés aux séquences identifiées, les fonctions de ces gènes peuvent être déterminées.
Quelle est la technique utilisée en métagénomique ?
Un échantillon de la communauté microbienne est prélevé dans l'eau de mer, les sédiments, l'animal hôte ou tout autre habitat marin. Les cellules collectées sont ensuite lysées et l'ADN est extrait de leur lysat. La technique qui rend la métagénomique possible est le shotgun sequencing, qui séquence des régions aléatoires d'ADN de manière non ciblée.
Quelles sont les 3 étapes d'une étude métagénomique ?
Étapes et processus de métagénomique:
- Collection d'échantillons:
- Extraction d'ADN:
- Préparation des échantillons:
- Analyse d'échantillon:
Comment se déroule la métagénomique fonctionnelle ?
La métagénomique fonctionnelle consiste à isoler l'ADN des communautés microbiennes pour étudier les fonctions des protéines codées. Cela implique le clonage de fragments d'ADN, l'expression de gènes dans un hôte de substitution et le dépistage d'activités enzymatiques.
